يحفظ الزعفران بعيداً عن الرطوبة والضوء في مكان جاف. الأوعية المعدنية ثم الزجاجية الملونة ذات الأغطية أفضل العبوات لتخزين الزعفران.
يفضل طحن الزعفران عند استعماله كما يفضل استعمال المسحوق بسرعة لأن المستخلص العطري يتبخر بسرعة في حالة المسحوق مما يقلل من اللون.
